汪小龙

一、个人简介

姓名：汪小龙

学历：博士

职称：副教授

邮箱：Xiaolong@ouc.edu.cn

二、在海德教授课程名称

《分子生物学实验》、《遗传学实验》

三、研究方向

目前研究方向为生物技术制药、分子生物技术、生物信息学、计算生物学及其交叉学科。研究兴趣包括开发和应用新型核酸扩增技术，设计和开发新型基因转移、基因表达调控及基因治疗的方法和药物（包括反义寡核苷酸、siRNA和miRNA等）。开发新型生物计算算法，编写用户友好的生物信息学软件，用于DNA和蛋白质序列分析，数据挖掘，进行蛋白质空间结构模拟、分子系统发生、分子进化和分子生物学研究。另外，本人还对DNA计算机研究感兴趣，开发新型DNA计算算法。

（1）在生物制药和分子生物技术领域：首创了一种新型核酸扩增技术，称为聚合酶-内切酶扩增反应（Polymerase-endonuclease Amplification Reaction, PEAR）, 该技术已经获得国家发明专利授权，并已经申请国际专利。PEAR技术具有重要的科学意义和应用价值：可用于扩增寡核苷酸和小RNA，可制备反义寡核苷酸药物，用于基因调控和基因治疗等研究。与化学合成法相比，PEAR扩增和制备反义寡核苷酸设备成本低、无污染，而且产物纯度高，易于实现规模化和自动化生产。

（2）在生物信息和生物计算领域：目前蛋白及其编码DNA序列的比对和进化分析，是分别进行的，但二者往往会得出截然不同的结论。本人开发了一种新型核酸和蛋白质序列联合比对分析方法和软件——“密码子-氨基酸联合序列比对”（Codon and Amino-acid Unified Sequence Alignments, CAUSA），将蛋白质编码DNA序列和其氨基酸序列组合，统一进行多序列比对，不仅大大提高了DNA和蛋白质序列比对的精确度，而且发现了几种新的插入/缺失序列变异模式。从理论上证明了CAUSA联合序列比对的熵信息量更大。通过对HIV等病毒蛋白基因的实例分析，证实了用CAUSA软件比对结果画进化树，能够克服分子系统和进化分析中常见的进化树不准确和不一致问题，能够更清楚地解释进化事件，并使蛋白质空间结构模拟结果也更加准确。该软件目前已发布2.0版，可在网站免费下载使用。

（3）在DNA计算机领域：本人提出了一种新型DNA计算方法，用连接酶链式反应（Ligase Chain Reaction, LCR）技术解决了计算机科学中著名的SAT难题，并构建了数字逻辑电路，与国际同类研究相比具有容错性好，灵敏度高，时间/空间复杂度低等优势。

四、研究成果

代表性论文：

Biao Li, Shihua Dong, Jiajun Wu, Jianye Zhang, Gang Chen, Quanjiang Dong, Xinhong Zhu, Xiaolong Wang* (2013) Preparation of5′-O-(1-Thiotriphosphate)-ModifiedOligonucleotides UsingPolymerase-Endonuclease Amplification Reaction (PEAR). PLoS ONE 8(7): e67558. doi:10.1371/journal.pone.0067558

Shuang-yong Xu, Rebecca L. Nugent, Julie Kasamkattil, Alexey Fomenkov, Yogesh Gupta, Aneel Aggarwal, Xiaolong Wang, Zhiru Li, Yu Zheng, and Richard Morgan (2012) Characterization of Type II and III restriction-modification systems from Bacillus cereus strains ATCC10987 and ATCC14579, Journal of Bacteriology, 194(1): 49-60, doi:10.1128/JB.06248-11 (SCI IF 2010: 3.726)

Xiaolong WANG, Deming GOU, Shuang-yong XU. (2010)Polymerase-Endonuclease Amplification Reaction (PEAR) for Large-Scale Enzymatic Production of Antisense Oligonucleotides. PLoS ONE, 5(1): e8430. doi:10.1371/journal.pone.0008430. (SCI IF 2010: 4.351)